三魔被封印后，基地内众人开始着手修复受损设施，同时对三魔的来历展开调查。
孙悟空在翻阅基地内的古老典籍时，发现了一段关于米修斯之印的隐秘记载。原来，米修斯之印不仅是封印黑暗力量的神器，其碎片散落各地时，也会吸引一些黑暗生物前来争夺，三魔很可能就是被米修斯之印的力量吸引而来。并且，典籍中还提到，在遥远的黑暗深渊，有一个神秘组织正在谋划唤醒更强大的黑暗存在，三魔或许只是他们派出的先遣部队。
“看来我们面临的威胁远比想象中更大。”孙悟空将这个发现告知了众人。唐僧皱起眉头，说道：“那我们更要加快‘希望之源’净化系统的建设，增强基地的防御能力，同时也得派人去寻找米修斯之印的其他碎片，不能让它们落入邪恶势力手中。”
于是，众人决定兵分两路。马嘉祺、丁程鑫带领时代少年团部分成员，以及王俊凯、王源、易烊千玺等人组成探寻小队，前往黑暗深渊附近寻找米修斯之印碎片的线索；迪丽热巴、张艺兴则带领另一部分人留在基地，协助唐僧师徒加快净化系统的建设。
探寻小队踏上了征程，一路上小心翼翼。然而，他们刚靠近黑暗深渊，就感受到了浓烈的黑暗气息。突然，一群黑色的蝙蝠从四面八方飞来，它们的眼睛闪烁着红光，尖牙锋利，直扑众人。
“小心这些蝙蝠！它们可能带有腐蚀性毒液。”宋亚轩大声提醒道。刘耀文和严浩翔立刻冲上前，用手中的武器挥舞，试图驱散蝙蝠群。马嘉祺则施展音波攻击，强大的音波将一些蝙蝠震落在地。丁程鑫利用舞蹈所蕴含的能量，形成一道道光影屏障，阻挡蝙蝠的靠近。
TFBOYS三人也不甘示弱，王俊凯凝聚冰元素，形成冰墙，将蝙蝠挡在外面；王源操控雷电，电击蝙蝠群；易烊千玺则开启时空漩涡，将部分蝙蝠吸入其中。
就在众人与蝙蝠激战之时，地面突然裂开，几只巨大的触手从地下伸出，试图抓住队员们。“这又是什么怪物？”贺峻霖惊呼道。张真源连忙操控水流，冲击触手，同时鹿晗操控机械飞鸟，对触手进行攻击。
经过一番苦战，众人终于击退了蝙蝠和触手怪物。但他们知道，这只是黑暗深渊的小小考验，前方还有更多未知的危险等着他们。而此时，留在基地的人员也遇到了麻烦，一些被黑暗力量感染的变异生物开始不断袭击基地防线，迪丽热巴、张艺兴等人能否守住基地？探寻小队又能否顺利找到米修斯之印碎片的线索？一切都还是未知数……
【触发新剧情：黑暗深渊的考验。任务：成功通过黑暗深渊外围的考验，找到米修斯之印碎片的线索。】
黑暗深渊的外围，浓雾弥漫，空气中夹杂着一股腐朽的腥甜气味。马嘉祺挥手示意众人停下，目光紧盯着前方一片诡异的寂静。
“不太对劲。”他低声说，“刚才那些蝙蝠和触手像是被刻意安排好的——更像是……试探。”
丁程鑫点了点头，手中凝聚的光影屏障微微闪烁着，随时准备展开。“有人在暗处观察我们。”
话音刚落，前方浓雾中传来一阵低沉的鼓声，节奏诡异，仿佛直接敲击在心脏上。宋亚轩捂住胸口，脸色微变：“这鼓声能影响心跳频率！”
“交给我。”王源踏前一步，双掌合拢，雷电之力在周身噼啪作响。他猛地将雷电灌入地面，一道弧光沿着地表向前蔓延，精准地击中了隐藏在雾中的一面黑色大鼓。鼓声戛然而止，雾气中传来一声闷哼，随即几个黑影迅速后撤。
“追！”刘耀文和严浩翔几乎同时冲出，但马嘉祺立刻叫住了他们。
“别追，可能是调虎离山。”
易烊千玺已经开启了时空感知，闭目片刻后睁开眼：“前方三百米处有一个巨大的能量源，很稳定，不像是活物。如果我没猜错，那应该就是米修斯之印碎片的藏匿点。”
众人对视一眼，小心翼翼地向前推进。穿过浓雾后，眼前出现了一座残破的祭坛，祭坛中央悬浮着一块散发着微弱金光的碎片——正是米修斯之印的碎片之一。
但碎片周围，盘踞着一条浑身漆黑、鳞片泛着幽光的巨蟒，它的身躯几乎缠绕了整个祭坛，一双竖瞳冷冷地盯着来客。
“这是……黑暗深渊的守护兽？”贺峻霖咽了口唾沫。
张真源仔细观察着巨蟒，忽然发现它的颈部有一处鳞片颜色略浅，像是旧伤。“它的弱点在颈部左侧！”
王俊凯立刻会意，冰元素在掌心凝聚成一支锋利的冰矛。与此同时，丁程鑫展开光影屏障作为掩护，刘耀文和严浩翔从两侧吸引巨蟒的注意力。
巨蟒张开大口，喷出一股黑色的毒雾。宋亚轩迅速展开音波屏障，将毒雾震散。王源的雷电和易烊千玺的时空斩同时击中巨蟒的身体，令它痛苦地扭动身躯，露出了颈部那一小片浅色鳞片。
就是现在！
王俊凯掷出冰矛，精准地刺入那片鳞片。巨蟒发出一声震天的嘶鸣，庞大的身躯轰然倒地，溅起一片尘土。
“快去拿碎片！”马嘉祺喊道。
丁程鑫冲上祭坛，小心翼翼地取下金色碎片。就在碎片脱离祭坛的瞬间，整座祭坛开始崩塌，地面剧烈震动。
“撤！”众人全力向外奔跑，身后祭坛不断坍塌，掀起滚滚尘埃。
当他们冲出浓雾，重新站在安全地带时，所有人都不约而同地回头看了一眼——黑暗深渊的方向，似乎有一双更加巨大的眼睛，在黑暗中缓缓睁开，又缓缓闭上。
“这只是开始。”马嘉祺握紧手中的碎片，目光坚定，“我们得赶紧回去，把这个消息告诉其他人。”
【任务完成：成功通过黑暗深渊外围的考验，获得米修斯之印碎片×1。奖励：深渊守护兽鳞片×3，黑暗抗性药剂配方×1。】
而此时，基地那边，迪丽热巴正站在城墙上，看着远处密密麻麻涌来的变异生物，深吸一口气。
“准备战斗。”
她身后的“希望之源”净化系统，正在缓缓亮起第一缕光芒。